Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms