Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ubp1Q811S7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubp1Q811S7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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