Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc50Q810U5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc50Q810U5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc50Q810U5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc50Q810U5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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