Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna12Q80SS5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms