Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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