Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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