Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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