Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubfd1Q78JW9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms