Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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