Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms