Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx13Q6PHS6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms