Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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