Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trak2Q6P9N8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms