Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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