Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms