Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms