Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sv2cQ69ZS6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms