Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms