Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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