Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms