Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms