Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfrcQ62351 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms