Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms