Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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