Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igbp1Q61249 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igbp1Q61249 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igbp1Q61249 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms