Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms