Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbbp4Q60972 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms