Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms