Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Samhd1Q60710 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms