Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms