Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssh2Q5SW75 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms