Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rbm27Q5SFM8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm27Q5SFM8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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