Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms