Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2Q3V1H1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms