Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pfdn4Q3UWL8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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