Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms