Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms