Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms