Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms