Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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