Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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