Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms