Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem88bQ3TYP4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms