Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam107bQ3TGF2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam107bQ3TGF2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms