Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms