Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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