Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms