Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms