Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms