Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms